Projeto visa democratizar uso de aprendizado de máquina nas ciências biológicas

Ferramenta computacional desenvolvida por estudante do ICMC-USP venceu a primeira edição do Prêmio J. F. Marar de Inteligência Artificial para a Graduação

Agência FAPESP – Um projeto que visa democratizar as aplicações das técnicas de aprendizado de máquina na área de ciências biológicas venceu a primeira edição do Prêmio J. F. Marar de Inteligência Artificial para a Graduação, promovido pelo Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação da Universidade de São Paulo (ICMC-USP).

Intitulado “BioDeepFuse: empoderando pesquisadores em ciências da vida com aprendizado profundo”, o projeto de iniciação científica foi conduzido por Breno Livio Silva de Almeida com apoio da FAPESP e orientação do professor do ICMC André Carlos Ponce de Leon Ferreira de Carvalho.

Como trabalho de conclusão do curso de ciências da computação, Almeida desenvolveu uma ferramenta computacional que ajuda a compreender dados de elementos do genoma humano que não atuam na produção de proteínas, sendo por isso chamados de “não codificantes” ou “não traduzidos” (ncRNA). Esses elementos compõem cerca de 97% do genoma humano e são importantes para a regulação de vários processos biológicos. Estão associados ao desenvolvimento de diversas doenças, daí a relevância de usar soluções de aprendizado de máquina para classificá-los automaticamente e identificar alterações que possam levar a doenças.

“Usando conjuntos de dados de referência e amostras de RNA do mundo real de organismos bacterianos, avaliamos o desempenho do BioDeepFuse. Os resultados exibiram alta precisão na classificação de ncRNA, ressaltando a robustez de nossa ferramenta no enfrentamento de desafios complexos de dados de sequências de ncRNA”, escreveu o estudante na apresentação do projeto. O sistema está disponível no GitHub.

A cerimônia de premiação será realizada amanhã (29/02), às 10 horas, no auditório Fernão Stella de Rodrigues Germano do ICMC, av. Trab. São Carlense, 400, Centro, São Carlos, SP. Gratuita e aberta a todos os interessados, a cerimônia será realizada durante a Semana de Recepção aos Calouros do ICMC.

O Prêmio J. F. Marar de Inteligência Artificial para a Graduação nasceu de uma parceria do ICMC com a família do professor João Fernando Marar, que trabalhava no Departamento de Computação da Faculdade de Ciências da Universidade Estadual Paulista (Unesp) em Bauru e morreu em 2019. Marar fez graduação e mestrado no ICMC. Esta é a primeira edição do prêmio, que passa a ser oferecido anualmente.