Bolsista deverá desenvolver, treinar e avaliar a precisão de um modelo de classificação para identificar exosítios de proteínas com base na estrutura tridimensional das moléculas (imagem: Wikimedia Commons)
Pós-doutorado em biologia computacional estrutural na Unesp de São José do Rio Preto
18 de agosto de 2022
Bolsista deverá desenvolver, treinar e avaliar a precisão de um modelo de classificação para identificar exosítios de proteínas com base na estrutura tridimensional das moléculas
Pós-doutorado em biologia computacional estrutural na Unesp de São José do Rio Preto
Bolsista deverá desenvolver, treinar e avaliar a precisão de um modelo de classificação para identificar exosítios de proteínas com base na estrutura tridimensional das moléculas
18 de agosto de 2022
Bolsista deverá desenvolver, treinar e avaliar a precisão de um modelo de classificação para identificar exosítios de proteínas com base na estrutura tridimensional das moléculas (imagem: Wikimedia Commons)
Agência FAPESP – O Projeto Temático “Exosítios de proteínas, sítios crípticos e moonlighting: identificação, mapeamento funcional e efeitos de alteração estrutural” oferece uma oportunidade de pós-doutorado com bolsa da FAPESP. O prazo de inscrição termina em 25 de agosto.
A pesquisa é conduzida no Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas da Universidade Estadual Paulista (Ibilce-Unesp), campus São José do Rio Preto.
O pós-doutorando será responsável por desenvolver, treinar e avaliar a precisão de um modelo de classificação para identificar exosítios de proteínas com base nas estruturas tridimensionais dessas moléculas; desenvolver um pipeline para identificar possíveis proteínas de interação integrando as informações obtidas dos experimentos de phage display, a identificação de exosítios usando a classificação do modelo gerado na primeira etapa e as informações disponíveis sobre colocalização nos mesmos compartimentos celulares das proteínas parceiras propostas; identificar os parceiros proteína-proteína que interagem por meio da ligação em loci de exosítios; e realizar triagem virtual de compostos do banco de dados ZINC nos exosítios identificados das proteínas-alvo para propor possíveis candidatos a fármacos.
Para candidatar-se é preciso ter doutorado em biofísica, física, matemática ou ciência da computação, com ênfase em biologia estrutural computacional e conhecimentos gerais em bioquímica/biologia estrutural. Boas habilidades computacionais e experiência com Linux, alguma linguagem de programação, MySQL, conhecimentos em análise estatística SHAP e dos softwares Discovery Studio e Pipeline Pilot são diferenciais.
Os interessados podem se inscrever pelo e-mail do professor Raghuvir K. Arni (raghuvir.arni@unesp.br).
Mais informações sobre a vaga em: www.fapesp.br/oportunidades/5305.
A oportunidade está aberta a brasileiros e estrangeiros. O selecionado receberá Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP no valor de R$ 8.479,20 mensais e Reserva Técnica equivalente a 10% do valor anual da bolsa para atender a despesas imprevistas e diretamente relacionadas à atividade de pesquisa.
Caso o bolsista de PD resida em domicílio fora da cidade na qual se localiza a instituição-sede da pesquisa e precise se mudar, poderá ter direito a um auxílio-instalação. Mais informações sobre a Bolsa de Pós-Doutorado da FAPESP estão disponíveis em www.fapesp.br/bolsas/pd.
Outras vagas de bolsas, em diversas áreas do conhecimento, estão no site FAPESP-Oportunidades, em www.fapesp.br/oportunidades.
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